Zeitleisten A, B: 1962

Die menschliche CIA-Agentin Moira MacTaggert deckt versehentlich die Existenz des Hellfire Clubs auf, einer mysteriösen Organisation unter der Leitung von Schmidt, die mittlerweile unter der Identität Sebastian Shaw und mehreren anderen Mutanten operiert. Moria bittet Charles um Rat bezüglich Mutationen, was dazu führt, dass er mit der CIA zusammenarbeitet, um eine Taskforce zu bilden, die Shaw aufhalten soll. Zu dieser gehören Raven, Erik, Dr. Hank McCoy, Angel Salvadore, Armando Muñoz, Alex Summers und Sean Cassidy.
Armando kommt bei einem Angriff auf die Mutanten durch den Hellfire Club ums Leben, und die Schlacht wird zum Brutkasten der Kubakrise , als Shaw die Streitkräfte in Moskau manipuliert, um Interkontinentalraketen in Kuba zu installieren. In der folgenden Schlacht wird Shaw von Erik getötet, und Charles wird von der Hüfte abwärts durch eine abgelenkte Kugel gelähmt. durch Eriks magnetische Kräfte. Aufgrund der ideologischen Kluft zwischen den beiden gründet Erik, der nun den Namen Magneto vertritt, mit Raven, den überlebenden Mitgliedern des Hellfire Clubs und Angel die Bruderschaft der Mutanten, während Charles beschließt, auf sein Anwesen in Westchester zurückzukehren, um eine Schule für „begabte Schüler zu eröffnen. (X-Men: Erste Entscheidung)